علوم سلولي و مولكولي

خبر

cmbio — Wed, 04 Nov 2009 15:08:04 GMT

با سلام

حتما دوستانی که می خواستند ارشد شرکت کنند آن هم از نوع ایمونولوژی متوجه شده اند که این رشته امسال در رشته های شناور کارشناسی ارشد علوم پایه ارائه نشده . البته این اتفاق اولین بار نیست که می افتد چون من سالهای پیش هم این موضوع را در رشته های دیگر دیده بودم.

با تشکر از دونه های برف من که اصلا حواسم نبود!

خبر

cmbio — Wed, 09 Sep 2009 13:05:18 GMT

خبری در رابطه با رشته بيو فيزيك

به نقل از سایت سازمان سنجش :

رشته بيو فيزيك از دفترچه راهنماي شماره يك، از مجموعه زيست‌شناسي حذف گرديد لذا پذيرش دانشجو در اين رشته در دفترچه شماره 2 (راهنماي انتخاب رشته) آزمون تحصيلات تكميلي از بين داوطلبان مجاز به انتخاب رشته كه در آزمون رشته‌هاي زير شركت نموده‌اند صورت مي‌گيرد:
1- مجموعه شيمي (كد 1203) با مواد و ضرايب گرايش شيمي فيزيك
2- مجموعه فيزيك (كد 1204)
3- مجموعه زيست‌شناسي (كد 1206) با مواد و ضرايب گرايش بيوشيمي

گرایش های زیست شناسی

cmbiooo — Sat, 18 Jul 2009 20:44:18 GMT

جهت آشنایی بیشتر دوستان با رشته زیست شناسی به شرح گرایش ها ، ظرفیت پذیرش در مقطع کارشناسی ارشد و انواع دانشگاه ها جهت ادامه تحصیل در مقطع کارشناسی ارشد این رشته می پردازیم :

گرایش های زیست شناسی در مقطع کارشناسی :

عمومی
علوم گیاهی
علوم جانوری
دریا
سلولی و مولکولی
ژنتیک
بیوتکنولوژی ( زیست فنآوری )
دبیری زیست شناسی

اما فارغ التحصیلان این رشته در چه دانشگاه هایی و چه گرایش هایی می توانند( در ایران ) ادامه تحصیل بدهند :

الف : دانشگاه ها :

دانشگاه های وابسته به وزارت علوم
دانشگاه های وابسته به وزارت بهداشت
دانشگاه آزاد
دانشگاه های بین المللی ( مثل دانشگاه کیش وابسته به دانشگاه تهران )
دانشگاه های پیام نور که از طریق فراگیری دانشجو می پذیرند.

نکته : طی چند سال اخیر ادامه تحصیل از مقطع کارشناسی زیست شناسی به پزشکی در دانشگاه تهران فراهم شده که این طرح در مرحله آزمایشی است ( برای دانستن شرایط ادامه تحصیل در رشته پزشکی کلیک کنید )

شرایط پذیرش دانشجوی پزشکی از مقطع کارشناسی دانشگاه علوم پزشکی تهران در سال 1386 :

لف) شرايط ورود به دوره

1- مجاز بودن به تحصيل از نظر قوانين و مقررات جاري كشور

2- برخورداري از سلامت تن و روان بر اساس ضوابط شوراي عالي برنامه ريزي

3- فارغ التحصيل مقطع كارشناسي كليه رشته هاي مصوب گروه علوم پزشكي

4- حداكثر سن در زمان ثبت نام آزمون 25 سال تمام

5- معدل كل ديپلم بالاتر از 18

6- معدل مقطع كارشناسي بالاتر از 16

7- داراي مدرك معتبر زبان انگليسي طبق جدول 1

8- قبولي در آزمون ورودي

تبصره: دانشجويان مشمول آيين نامه استعدادهاي درخشان در رشته هاي مورد پذيرش از بند پنج و شش آيين نامه معاف مي باشند.

ب) آزمون ورودي

1- آزمون ورودي از دو آزمون كتبي و آزمون‌هاي فراشناختي تشكيل مي شود.

1-1- آزمون كتبي شامل سؤالات چندگزينه اي بوده و مواد درسي آن به شرح زير است.

فيزيولوژي نظري (ضريب 3)، ميكروب شناسي شامل باكتري شناسي، ويروس شناسي و انگل شناسي پزشكي (ضريب 3)، آناتومي نظري (ضريب 3)، بيوشيمي نظري (ضريب 2)، بافت شناسي نظري (ضريب 2)، ايمونولوژي نظري (ضريب 2)، زبان عمومي (ضريب 2)، ژنتيك (ضريب 1)، روانشناسي (ضريب 1)، تغذيه (ضريب 1)، فيزيك پزشكي (ضريب 1)، دروس اصول خدمات بهداشتي و بهداشت و تنظيم خانواده (ضريب 1)، دروس اصول اپيدميولوژي و مبارزه با بيماري ها و آمار مقدماتي (ضريب 1)

2-1- آزمون كتبي هم حد نصابي و هم رقابتي است. از بين كساني كه حد نصاب قبولي را آورده اند دو برابر ظرفيت پذيرش، از بالاترين نمرات، براي ورود به مرحله مصاحبه پذيرفته مي شوند.

2- آزمون‌هاي فراشناختي از دو مرحله مصاحبه و آزمون كتبي بررسي توانايي‌هاي فراشناختي و تفكر انتقادي تشكيل مي‌شود.

1-2- پذيرفته شدگان آزمون كتبي به مرحله مصاحبه وارد مي شوند.

2-2- مصاحبه حضوري بر اساس چك ليست بوده و دو مرتبه توسط دو تيم آزمون گيرنده مستقل انجام مي شود. ميانگين اين دو مصاحبه نمره نهايي مصاحبه حضوري است.

3-2- آزمون تعيين توانايي هاي فرا شناختي به صورت سؤالات چندگزينه اي است و براي تمامي پذيرفته شدگان در آزمون كتبي برگزار مي شود.

3- پذيرش نهايي به تعداد نصف پذيرفته شدگان آزمون كتبي و بر اساس فرمول زير است:

معيار	درصد
نتيجه آزمون كتبي	70 %
ميانگين نتايج دو مصاحبه حضوري و آزمون تعيين توانايي هاي فرا شناختي و تفكر انتقادي	30 %

تبصره: شرط لازم براي قبولي كسب حدنصاب تعيين شده در مراحل آزمون خواهد بود.

جدول 1. فهرست مدارك زبان انگليسي مورد قبول براي پذيرش دانشجوي پزشكي از مقطع كارشناسي

نام مدرك زبان	حد نصاب قبولي
TOEFL	500
IELTS	6
MCHE	50

داوطلباني كه شرايط ورود به دوره را كسب كرده ولي مدرك زبان ندارند به طور مشروط ثبت نام به عمل آمده و بايد تا قبل از آزمون جامع علوم پايه مدرك مذكور را ارائه كنند، در غير اينصورت از ادامه تحصيل منع خواهند شد.

ب : گرایش ها

اول : گرایش های زیست شناسی در دانشگاه های وابسته به وزارت علوم :

گرایش های علوم گیاهی شامل : سیستماتیک اکولوژیک ، فیزیولوژی گیاهی ، زیست شناسی تکوینی، اکولوژی ( تاکسونومی ، سیستماتیک )
گرایش علوم جانوری شامل : فیزیولوژی جانوری ، سلولی تکوینی ، بافت شناسی و جنین شناسی ، بیوسیستماتیک جانوری ، بافت شناسی آبزیان ، بافت جنین شناسی
علوم سلولی و مولکولی
ژنتیک
بیوتکنولوژی ( زیست فناوری ) : امسال فقط گرایش میکروبی پذیرش داشته است.
میکروبیولوژی
بیوفیزیک
بیوشیمی

چند نکته :

آزمون زیست شناسی به عنوان مجموع زیست شناسی برگزار می شود ، بدین معنی شما در روز جلسه امتحان کارشناسی ارشد وزارت علوم سوالات تمامی گرایش های فوق ( به جز بیوتکنولوژی ) را دریافت می کنید اما زمان مناسب برای جواب دادن به سوالات همه گرایشات در اختیار شما قرار داده نمی شود.
رشته بیوتکنولوژی به عنوان رشته شناور می باشد. بدین معنی که آزمون آن جدا از سایر گرایشات می باشد و می توان همزمان سایر گرایشات زیست شناسی را در قالب مجموعه زیست شناسی و بیوتکنولوژی را به عنوان رشته شناور جهت شرکت در آزمون کارشناسی ارشد انتخاب کرد. در این صورت شما در 2 کنکور به صورت جداگانه شرکت کرد. ( معمولا کنکور گرایش بیوتکنولوژی در روز های پنجشنبه و سایر گرایشات در روز جمعه می باشد ).

امتحان کنکور وزارت علوم در بهمن ماه انجام می گیرد.

دانلود :

دانلود ظرفیت پذیرش دانشجوی کارشناسی ارشد وزارت علوم در رشته های علوم پایه 1388 حجم تقریبی = 320kb

ظرفیت پذیرش در سال 1388:

کلیه گرایش های علوم گیاهی : روزانه 174 نفر ، شبانه : 107 نفر ، پیام نور : 30نفر. مجموع :311 نفر
کلیه گرایش علوم جانوری : روزانه 146 نفر ، شبانه 75 نفر ، پیام نور : 30 نفر ، غیرانتفاعی : 5 نفر . مجموع 256 نفر
علوم سلولی و مولکولی : روزانه 86 نفر ، شبانه 11 نفر ، غیرانتفاعی 15 نفر . مجموع 127 نفر
ژنتیک : روزانه 32 نفر ، شبانه 8 نفر ، مجموع : 40 نفر
بیوتکنولوژی ( زیست فناوری ) : روزانه 12 نفر ( 5 نفر دانشگاه الزهراء) ، شبانه 3 نفر . مجموع 15 نفر
میکروبیولوژی : روزانه 29 نفر ، شبانه 10 نفر . مجموع 39 نفر
بیوفیزیک : روزانه 16 نفر ، شبانه 6 نفر . مجموع 22 نفر
بیوشیمی : روزانه 50 نفر ، شبانه 35 نفر ، پیام نور : 30 نفر . مجموع : 115 نفر

دوم : گرایش های زیست شناسی در دانشگاه های وابسته به وزارت بهداشت :

انگل شناسی ( گرایش های عمومی ، جانوری ، میکروبیولوژی و سلولی و مولکولی می توانند این رشته را انتخاب کنند ) : ظرفیت پذیرش : 34 نفر
ایمنی شناسی ( گرایش های عمومی ، جانوری ، ژنتیک ، میکروبیولوژی و سلولی و مولکولی می توانند این رشته را انتخاب کنند ). ظرفیت پذیرش : 33 نفر
بیوشیمی بالینی ( کلیه گرایش های زیست شناسی ). ظرفیت پذیرش: 55 نفر
حشره شناسی پزشکی و مبارزه با ناقلین ( کلیه رشته ها ). ظرفیت پذیرش: 13 نفر
ژنتیک انسانی (کلیه گرایش های زیست شناسی). ظرفیت پذیرش: 26 نفر
علوم تشریحی (کلیه گرایش های زیست شناسی) . ظرفیت پذیرش: 34 نفر
علوم تغذیه ( زیست جانوری ، عمومی ، سلولی و مولکولی ، شیلات و آبزیان ): ظرفیت پذیرش: 36 نفر
علوم بهداشتی در تغذیه ( زیست جانوری ، میکروبیولوژی ، سلولی و مولکولی ). ظرفیت پذیرش: 14 نفر
فیزیولوژی (کلیه گرایش های زیست شناسی). ظرفیت پذیرش: 46 نفر
قارچ شناسی پزشکی (کلیه گرایش های زیست شناسی). ظرفیت پذیرش: 9 نفر
میکروبیولوژی (کلیه گرایش های زیست شناسی). ظرفیت پذیرش: 45 نفر
ویروس شناسی پزشکی (کلیه گرایش های زیست شناسی). ظرفیت پذیرش: 13 نفر
خون شناسی آزمایشگاهی و بانک خون (کلیه گرایش های زیست شناسی). ظرفیت پذیرش: 24 نفر
سم شناسی (کلیه گرایش های زیست شناسی). ظرفیت پذیرش: 26 نفر
نانوتکنولوژی پزشکی (کلیه گرایش های زیست شناسی). ظرفیت پذیرش: 6 نفر
بیوتکنولوژی پزشکی (کلیه گرایش های زیست شناسی) . ظرفیت پذیرش: 19 نفر
رادیوبیولوژی و حفاظت پرتویی ( زیست شناسی سلولی و مولکولی ، ژنتیک ). ظرفیت پذیرش: مشخص نشده

چند نکته :

امتحان کنکور کارشناسی ارشد وزارت بهداشت در اواخر خرداد ماه انجام می گیرد.
سهمیه های انتخابی جهت شرکت در آزمون کارشناسی ارشد وزارت بهداشت به قرار : 1 – سهمیه کارکنان وزارت بهداشت ( 20 % ) 2- سهمیه کارکنان مناطق محروم وزارت بهداشت و موسسات وابسته ( 10% ) 3- سهمیه رزمندگان ( 20% ) 4 – سهمیه آزاد ( 50 % )

دانلود :

دانلود دفترچه کامل کنکور کارشناسی ارشد وزارت بهداشت سال 1387 ( جهت پذیرش دانشجو در سال 1388 ) . حجم تقریبی = 3.8M

سوم : گرایش های زیست شناسی در دانشگاه های آزاد :

هر فارغ التحصیل می تواند تنها در یکی از رشته های زیر در آزمون کارشناسی ارشد دانشگاه آزاد اسلامی شرکت کند :

علوم جانوری
ژنتیک
سلولی و مولکولی
علوم گیاهی
میکروبیولوژی
بیوفیزیک
بیوشیمی
زیست دریا ( با گرایش های بوم شناسی دریا ، جانوران دریا ، آلودگی دریا، گیاهان دریا ، شیمی دریا ، فیزیک دریا )

نکته :

ظرفیت پذیرش در تمام رشته های علوم پایه 15 نفر می باشد.

دانلود :

دانلود دفترچه کامل کنکور کارشناسی ارشد دانشگاه آزاد سال 1387 ( جهت پذیرش دانشجو در سال ۱۳۸۸ ) حجم تقریبی = ۱.۲M

چهارم : گرایش های زیست شناسی در دانشگاه های بین المللی :

برای آگاهی از نحوه پذیرش دانشجو ، گرایش ها و میزان شهریه دانشگاه بین المللی کیش بر روی لینک زیر کلیک کنید.

http://kish.ut.ac.ir

پنجم : فراگیر پیام نور :

دارندگان مدارك كارشناسي رسمي مي توانند بدون توجه به نوع رشته كارشناسي خويش در دوره دانش پذيري هريك ازدوره هاي كارشناسي ارشد اعلام شده در زیر ثبت نام نمايند.

ليكن در صورتيكه رشته كارشناسي داوطلب با رشته كارشناسي ارشد انتخابي وي همنام و يا مشابه نباشد به تشخيص گروه آموزشي مربوط، چنين داوطلباني دردوره دانشجويي علاوه بر واحدهاي مصوب مقطع كارشناسي ارشد بايد تا حداكثر 24 واحد جبراني از مقطع كارشناسي همان رشته را با موفقيت بگذرانند.

رشته های علوم پایه و فنی مهندسی : زمین شناسی ( چینه شناسی و فسیل شناسی ) ، زیست شناسی ( علوم گیاهی ، جانوری ، بیوشیمی ) ، شیمی ( معدنی ، آلی ، تجزیه ، شیمی فیزیک ) ، مهندسی کشاورزی ( اقتصاد کشاورزی ، بیوتکنولوژی کشاورزی ) ، آمار ( ریاضی ) ، ریاضی ( کاربردی ، محض ) ، فیزیک ، مهندسی صنایع ، مهندسی کامپیوتر ( نرم افزار )

دانلود :

دانلود دفترچه کامل کنکور کارشناسی ارشد فراگیر پیام نور سال 1388 حجم تقریبی = 450kb

راهنمای دانلود :

تمام فایل ها در سایت www.2shared.com آپلود شده اند. جهت دریافت آنها پس از باز شدن لینک ، گزینه save file to your pc : click here را در انتهای صفحه پیدا کنید و بر روی click here ، کلیک کنید.

دانلود مطالب

cmbio — Thu, 07 May 2009 16:55:18 GMT

با سلام

برخی از دوستان در رابطه با دانلود مطالب با مشکل مواجه شده اند . خدمتتون عرض کنم که برای دریافت مطالب بخش آموزش با کلید بر روی لینک مربوطه وارد صفحه جدیدی می شوید. می توانید در پایین این صفحه با کلید بر روی گزینه download که یک فلش سبز رنگ در کنارش است دانلود خود را تکمیل کنید.

وبلاگ

cmbio — Mon, 27 Apr 2009 10:39:43 GMT

با سلام

از اینکه برخی دوستان لطف داشتند ونظر دادند ممنون هستیم .

خانم ثمین در مورد روش مولکولی بیوسنتز ریبوزوم ۸۰s پرسیده بودند. باید خدمتتان عرض کنیم که ما قبلا این موضوع را در قسمت آموزش بخش ریبوزوم توضیح داده ایم.و می توانید از آن استفاده کنید.

دوستان گرامی چند وقتی است که از آپ کردن وبلاگ عقب افتاده ایم که این موضوع به علت یک سری از مشکلات بوده و سعی می کنیم درآینده ای نچندان دور این موضوع را با ساختن یک سایت جبران کنیم.این متن را برای کسانی نوشتم که همیشه ما را با نظراتشان همراهی می کنند.

فصل 5 بخش A

cmbio — Fri, 27 Mar 2009 17:59:24 GMT

پردازش RNA

پردازش RNA سبب تولید mRNA بالغ ( برای ژن های پروتئین ) یا tRNA کاربردی و یا rRNA از رونوشت اولیه ( primary transcript ) می شود. در این بخش ، ما ابتدا درباره پردازش pre-mRNA و سپس درباره پردازش pre-RNA و pre-tRNA بحث خواهیم کرد.

پردازش pre-mRNA شامل مراحل زیر می شود :

· Capping : اضافه شدن 7-متیل گوانیلات ( m7G ) به انتهای 5َ

· پلی آدنیلاسیون : اضافه شدن دم پلی A به انتهای 3َ

· Splicing : حذف اینترون ها و اضافه شدن اگزون ها

در برخی نمونه ها ، RNA editing نیز صورت می گیرد.

شکل 5-A-1 فرآیند پردازش RNA برای تولید ژن های پروتئین ها

5َ- Capping

فرآیند capping پس از آغاز رونویسی سریعا آغاز می شود. ساختار شیمایی cap در شکل زیر نشان داده شده است ، جایی که m7G به اولین نوکلئوتید توسط پیوند 5َ-5َ تری فسفات متصل می شود. در اکثر جانوران ، نوکلئوتید اول در 2َ – هیدروکسیل ریبوز متیله می شود. در مهره داران ، نوکلئوتید دوم نیز متیله می شود.

شکل 5-A-2 تغییرات در انتهای 5َ

3َ پلی ادنیلاسیون

رزدیو های آدنیلات به انتهای 3َ اضافه می شوند. دم پلی A تقریبا دارای 250 رزدیو A در پستانداران و 100 رزدیو در مخمر ها می باشد.

شکل 5-A-3 . پلی آدنیلاسیون در انتهای 3َ . سیگنال اصلی برای برش 3َ سکانس AAUAAA می باشد. برش در نوکلئوتید 10-35 downstream و در سکانس ویژه ای اتفاق می افتد. سکانس سیگنال دوم تقریبا در 50 نوکلئوتیدی فرودست ( downstream ) سایت برش قرار دارد. این سیگنال دارای نواحی غنی از GU یا U می باشد.

پرداش pre-rRNA و pre-tRNA

Pre-rRNA ای که تازه رونویسی شده است مجموعه ای از سه rRNA می باشد : 18s , 5.8s و 28s( در پستانداران ). این ها برای فعال شدن باید از همدیگر جدا شوند. Pre-rRNA در هسته سنتز می شود. U3snRNA ( و دیگر snRNA های غنی از U ) به همراه پروتئین های وابسته در هسته در برش pre-rRNA دخالت دارند.

5s rRNA در نوکلئوپلاسم سنتز می شود. 5srRNA نیاز به پردازش ندارد و پس از سنتز به هسته وارد می شود تا با 28s و 5.8s rRNA بپیوندد و زیر واحد بزرگ ریبوزوم را تشکیل دهند.

Pre-tRNA برای تبدیل شدن به tRNA فعال احتیاج به پردازش های زیادی دارد. چهار نوع از تغییر شامل موارد زیر می شود :

1. توسط RNase P در انتهای 5َ قطعات اضافی ( حدود 16 نوکلئوتید ) حذف می شود.

2. اینترون ها ( حدود 14 نوکلئوتید ) درون لوپ آنتی کدون توسط splicing حذف می شوند.

3. دو رزدیو U توسط CCA ( که در تمامی tRNA های بالغ دیده می شوند ) در انتهای 3َ جایگزین می شوند

4. برخی از رزدیو ها به باز های ویژه ای برای مثال اینوزین ، دی هیدرو یوریدین و سودویوریدین تبدیل می شوند.

Review Articles:

tRNA Splicing - J. Biol. Chem., 1998.

The trials and travels of tRNA - Genes and Development, 1999.

فصل 4 بخش H4

cmbiooo — Thu, 08 Jan 2009 19:10:18 GMT

p53

p53 پروتئین متوقف کننده تومور است ، که همچنین به عنوان نگهبان ژنوم نیز معروف است . این پروتئین نقش های بسیار مهمی را در کنترل چرخه سلولی و آپوپتوزیس ایفا می کند. p53 معیوب اجازه می دهد تا سلول های غیر عادی تکثیر یابند و منجر به سرطان شوند. تقریبا 50% تومورهای انسانی دارای p53 جهش یافته اند.

در سلول های نرمال ، سطح پروتئین p53 پایین است . آسیب DNA و سیگنال های سایر استرس ها راه انداز افزایش پروتئین های p53 هستند ، که دارای سه عمل اصلی هستند : جلوگیری از رشد ، ترمیم DNA و آپوپتوزیس ( مرگ سلولی ). توقف رشد سلولی ، از پیشروی چرخه سلولی جلوگیری میکند و همانند سازی DNA را نیز متوقف میکند. در طی توقف پیشروی ، p53 ممکن است رونویسی از پروتئین هایی را فعال کند که در عمل ترمیم DNA نقش دارند. آپوپتوزیس آخرین عمل برای جلوگیری از رشد سلول هایی است که دارای DNA غیر نرمال هستند.

غلظت سلولی p53 باید با دقت تنظیم شود. زمانی این پروتئین می تواند تومور را متوقف کند که مقدار زیاد آن فرآیند aging ( پیر کردن ) را توسط فرآیند آپوپتوزیس با مقدار بسیار زیاد ، شتاب دهد. تنظیم کننده اصلی p53 ، Mdm2 می باشد ، که می تواند سبب کاهش سطح p53 توسط سیستم یوبی کویتین شود.

ژن های هدف

p53 یک فعال کننده رونویسی است که بیان Mdm2 را تنظیم میکند ( این عمل را برای تنظیم خودش انجام می دهد ) ، همچنین این پروتئین ژن های را که در متوقف سازی رشد ، ترمیم DNA و آپوپتوزیس نقش دارند را نیز تنظیم میکند. برخی از نمونه های مهم در زیر لیست شده اند :

Growth arrest: p21, Gadd45, and 14-3-3s.
DNA repair: p53R2.
Apoptosis: Bax, Apaf-1, PUMA and NoxA.

تنظیم p53

همانطور که در بالا اشاره شد ، p53 عمدتا توسط Mdm2 تنظیم می شود. مکانیسم تنظیم در شکل زیر به نمایش درآمده است.

شکل 4-H-5 تنظیم p53

( a ) بیان Mdm2 توسط p53 فعال می شود.

( b ) اتصال p53 به Mdm2 سبب راه اندازی کاهش سطح p53 توسط سیستم یوبی کویتین می شود.

( c ) فسفوریلاسیون p53 در Ser15 ، Thr18 و یا Ser20 اتصال آن را با Mdm2 را قطع میکند. در سلول های نرمال این سه رزدیو فسوریله نشده اند و p53 توسط Mdm2 در سطح و سیستم یوبی کویتین در سطح پایینی باقی می ماند.

( d ) آسیب DNA ممکن است پروتئین کینازی ( مانند ATM, DNA-PK, or CHK2 ) را برای فسفوریله کردن p53 در یکی از آن سه رزدیو فعال کند ، در نتیجه سطح p53 بالا می رود. زمانی که بیان Mdm2 توسط p53 فعال می شود ، افزایش سطح p53 سبب افزایش Mdm2 می شود ، اما Mdm2 نمی تواند تاثیری بر روی p53 داشته باشد زیرا آن فسفوریله است . پس از این که آسیب DNA ترمیم شد ، کیناز ATM به مدت زیادی فعال نخواهد ماند. p53 به سرعت دفسوریله می شود و توسط Mdm2 انباشته شده تخریب می شود.

نقش p53

نقش p53 در متوقف سازی رشد و آپوپتوزیس در شکل 4-H-6 نشان داده شده است.همچنین p53 به صورت مستقیم در ترمیم DNA نقش دارد. یکی از ژن های هدف رونویسی آن (p53R2 ) ریبونوکلئوتید رداکتاز را رمز گذاری می کند ، که برای همانند سازی و ترمیم DNA بسیار مهم است. همچنین p53 مستقیما با AP اندونوکلئاز و DNA پلیمراز در ارتباط است که هر دو در ترمیم شکافت بازی نفش دارند.

شکل 4-H-6 نقش p53 در توقف رشد و آپوپتوزیس

( a ) پیشرفت فرآیند چرخه سلولی به سمت فاز S محتاج به آنزیم Cdk2 می باشد ، که این آنزیم می تواند توسط p21 متوقف شود. پیشرفت فرآیند به فاز M نیاز به Cdc2 دارد که توسط p21 ، GADD45 و یا 14-3-3s میتواند متوقف شود. p53 بیان این پروتئین های بازدارنده را تنظیم می کند تا توقف رشد را القاء کند.

( b ) آپوپتوزیس می تواند توسط اتصال کاسپاز 9 به سیتوکروم c و Apaf1 القاء یابد. p53 بیان Apaf1 و Bax را فعال میکند ، سپس دومی می تواند سبب آزاد سازی سیتوکروم c از میتوکندری شود. ( میتوکندری ، آپوپتوزیس و aging را ببینید) .

Review Articles:

p53�Mdm2�the affair that never ends - Carcinogenesis, 2002.

Cell cycle checkpoint signaling through the ATM and ATR kinases - Genes and Development, 2001.

p53 from complexity to simplicity: mutant p53 stabilization, gain-of-function, and dominant-negative effect - FASEB J., 2000.

p53 protein at the hub of cellular DNA damage response pathways through sequence-specific and non-sequence-specific DNA binding - Carcinogenesis, 2001.

فصل 4 بخش H3

cmbiooo — Thu, 08 Jan 2009 18:58:18 GMT

تنظیم NF-kB

فاکتور هسته ای( kB (NF-kB ، فاکتور رونویسی یوبی کیتونی است که کنترل بیان ژن هایی را برعهده دارد که آن ها مسئول پاسخ ایمنی ، آپوپتوزیز و چرخه سلولی می باشند. تنظیم اشتباه فاکتور NF-kB ممکن است سبب بیماری های خود ایمنی ، عفونت ویروسی و سرطان شود. پنج عضو خانواده NF-kB در پستانداران شناخته شده اند :

NF-kB1 (also called p50)
NF-kB2 (also named p52)
RelA (also known as p65
RelB
c-Rel

هرکدام از آن ها دارای دامین همسان ( homology ) بسیار حفاظت شده Rel هستند که مسئول دایمریزاسیون و اتصال آن ها به DNA و IkB (inhibitor of NF-kB) می باشد. فاکتور رونوسی NF-kB تنها زمانی فعال است که دو عضو یک دایمر را تشکیل دهند. فرم بسیار فعال اغلب شامل p50 یا p52 و زیر واحد p65 می باشد.

شکل 4-H-3. ساختار کمپلکس NF-kB/DNA . فاکتور رونویسی NF-kB شامل دو زیر واحدp50 ( سبز رنگ ) و p65 ( قرمز رنگ ) می شود.

NF-kB می تواند توسط عوامل مختلفی از جمله سیتوکین ها ( مثل TNF-a and IL-1 ) ، میتوژن های سلول T و B ، پروتئین های ویروسی و القاء کننده های استرس ( مانند اکسیژن واکنش پذیر و یا اشعه UV ) فعال شود. در سیتوپلاسم NF-kBتوسط IkB القاء می شود. سیگنال فعال کننده Upstream ( برای مثال اتصال TNF-a به رسپتور ) سبب فسفورسیلاسیون IkB توسط ( IKK (IkB kinase شود. این عمل سبب راه اندازی کاهش میزان IkB در سیستم یوبی کویتین می شود . در این سیستم مولکول هدف توسط رشته ای از یوبی کویتین پوشیده می شود و توسط پروتوزوم 26S کاهش می یابد. NF-kB آزاد می تواند درون هسته جای بگیرد و رونویسی را فعال کند.

Review Articles:

New Insights into the Role of Nuclear Factor-kB in Cell Growth Regulation - Am J. Pathol., 2001.

NF-kB signaling pathways in mammalian and insect innate immunity - Genes and Development, 2001.

Series from Journal of Clinical Investigation (2001)

Series Introduction: The transcription factor NF-kB and human disease

NF-kB: a key role in inflammatory diseases

Toll-like receptor�mediated NF-kB activation: a phylogenetically conserved paradigm in innate immunity

Therapeutic potential of inhibition of the NF-kB pathway in the treatment of inflammation and cancer

Hostile takeovers: viral appropriation of the NF-kB pathway

Control of oncogenesis and cancer therapy resistance by the transcription factor NF-kB

NF-kB in neuronal plasticity and neurodegenerative disorders

NF-kB: pivotal mediator or innocent bystander in atherogenesis?

A ubiquitin ligase complex essential for the NF-kB, Wnt/Wingless, and Hedgehog signaling pathways - Genes and Development, 1999.

The Beginning of the End: IkB Kinase (IKK) and NF-kB Activation - J. Biol. Chem., 1999.

فصل 4 بخش H2

cmbiooo — Thu, 08 Jan 2009 18:36:18 GMT

تنظیم رپرسور لامبدا ( cI )

چرخه زندگی فاژ لامبدا توسط پروتئین های cI و Cro تنظیم می شود. اگر پروتئین های cI غالب باشد ، فاژ لامبدا در حالت لیزوژنیک باقی می ماند اما اگر پروتئین های Cro غالب باشند وارد چرخه لیتیک می شود. رونویسی از دو پروتئین ، توسط خود پروتئین cI ( رپرسور لامبدا ) انجام می گیرد.

شکل 4-H-2 . تنظیم رونویسی پروتئین های cI و Cro توسط cI انجام می گیرد. دایمر cI ممکن است به یکی از سه اپراتور به ترتیب O_R1 > O_R2 > O_R3 متصل شود. اتصال دایمر cI به O_R1 امکان اتصال دایمر دوم cI را به O_R2 زیاد می کند. بنابراین O_R1 و O_R2 بیشتر اوقات با هم توسط cI اشغال شده اند. هرچند این عمل سبب افزایش گرایش میان cI و O_R3 نمی شود ؛ و تنها زمانی توسط cI اشغال میشود که غلظت cI بالا باشد :

( a ) در غیاب پروتئین های cI ، ژن cro رونویسی می شود.

( b ) در صورت وجود پروتئین های cI ، تنها ژن cI رونویسی میشود.

( c ) در غلظت زیاد cI ، رونویسی از هر دو ژن متوقف می شود.

زمانی که DNA میزبان آسیب می بیند ( در زیر اشعه UV ) پروتئین cI ممکن است توسط پروتئاز اصلی که خود توسط پروتئین RecA فعال شده ، از هم جدا شود. پروتئین های برش یافته cI نمی توانند به اپراتور متصل شوند. بدین ترتیب ، پروتئین های Cro فاژ لامبدا را به چرخه لیتیک وارد می کنند.

فصل 4 بخش H1

cmbiooo — Thu, 08 Jan 2009 18:32:18 GMT

تنظیم رپرسور لک

اپران لک در E.coli شامل سه ژن می شود ( شکل ) : lacZ, lacY, and lacA ، بتا گالاکتوزیداز ، لاکتوز پرمئاز و تیوگالاکتوزید را رمز گذاری ( encoding ) می کنند. لاکتوز پرمئاز در غشای سلولی واقع شده است ، و قادر است لاکتوز را به درون سلول پمپ کند. بتا گالاکتوزیداز می تواند لاکتوز را به گلوکز و گالاکتوز تبدیل کند. (شکل 4-H-1 ). تیوگالاکتوزید ترانس استیلاز مسئول انتقال دهنده مولکول های کوچک است.

در غیاب لاکتوز ، رپرسور لک( شکل 4-D-3 ) مانع رونویسی از اپران لک می شود. لاکتوز می تواند به رپرسور لک متصل شود ، و از برهمکنش آن با سایت اتصال DNA اش جلوگیری می کند. بنابراین ( در زمانی که لاکتوز به مقدار کم موجود باشد ) ،اپران لک به سرعت رونویسی شده ، و آنزیم جهت تولید گلوکز ( مهمترین منبع انرژی E.coli ) را می سازد.

شکل 4-H-1 بتا گالاکتوزیداز میتواند لاکتوز را به گلوکز و گالاکتوز تبدیل کند.