فصل 4 بخش g3

رونویسی توسط استیلاسیون و د استیلاسیون هیستون ها تنظیم می شود

 

شکل 4-G-3 مثالی از فعالسازی رونویسی توسط استیلاسیون هیستون ها. P300/CBP می تواند با انواع مختلفی از تنظیم کنندگان رونویسی مثل pCAF ( نوعی هیستون استیل ترانسفراز ) و TPB ( که پروموتور را شناسایی میکند ) برهمکنش داشته باشد. در طی رونویسی ، این ها در ناحسه پروموتور بر روی هم قرار می گیرند. هیستون ها توسط p300/CBP استیله می شوند. pCAF و TAF III رونویسی را تسهیل می کنند.

 

 

شکل 4-G-4 مثالی از تقف رونویسی توسط د استیلاسیون هیستون ها. رپرسور دایمر Mad/Max با SIN3 یا  N-CoR, SMRT, etc برهمکنش دارد و از هیستون د استیلاز ها ( HDs )  برای توقف رونویسی استفاده می کند.

 

Review Articles:

Control of Cardiac Growth by Histone Acetylation/Deacetylation - Circulation Research, 2006.

Histone deacetylases (HDACs): characterization of the classical HDAC family - Biochem. J., 2003.

The Max Network Gone Mad - Molecular and Cellular Biology, 2001.

Deconstructing Myc - Genes and Development, 2001.

Co-repressors 2000 - FASEB J., 2000.

Transcriptional repression: the long and the short of it - Genes and Development, 2001.

فصل 4 بخش g2

CREB متصل شونده به پروتئین ( CEP ) و p300

CBP و p300 وابسته به  استیل ترانسفراز ها ( HATs ) می باشند. شکل زیر دامین ساختاری p300 را نشان می دهد.

 شکل 4-G-2 دامین ساختاری p300 و ناحیه ای که با تنظیم کننده های رونویسی برهمکنش دارد. Bromo نشان دهنده دامین( Bromo ( Bromodomain  است که به صورت اختصاصی به لیزین استیله شده متصل می شود.   "CH-1, CH-2 and CH-3" ناحیه های غنی از سیستئین / هیستیدین هستند.

Review Articles:

CREB-binding Protein and p300 in Transcriptional Regulation - J. Biol. Chem., 2001.

CREB-binding protein and p300: molecular integrators of hematopoietic transcription - Blood, 2000.

CBP/p300 in cell growth, transformation, and development  - Genes and Development, 2000.  

فصل 4 بخش g

استیلاسیون هیستون

 استیلاسیون رزدیو های لیزین در N ترمینال پروتئین های هیستون ، بار مثبت را از بین می برد و در نتیجه وابستگی میان هیستون و DNA را می کاهد. این عمل سبب می شود تا فاکتور های رونویسی و RNA پلیمراز به سادگی به ناحیه پروموتور دست یابند. بنابراین ، در اغلب موارد ، استیلاسیون هیستون رونویسی را افزایش و د استیلاسیون هیستون ها رونویسی را کاهش می دهد.

 

 

شکل 4-G-1 استیلاسیون و د استیلاسیون رزدیو های لیزین

استیلاسیون هیستون ها توسط هیستون استیل ترانسفراز ( HATs ) و د استیلاسیون هیستون ها توسط هیستون د استیلاز ( HD یا HDACs ) انجام می گیرد. چندین نوع مختلف HAT ها و HD ها شناخته شده است. در طی واکنش ها CBP/p300 بسیار مهم می باشد چون می تواند با تعداد بسیاری از تنظیم کنندگان رونویسی برهمکنش داشته باشد

Review Articles:

Hyperacetylated Chromatin Domains: Lessons from Heterochromatin - J. Biol. Chem., 2005.

Class II Histone Deacetylases: from Sequence to Function, Regulation, and Clinical Implication - Mole. Cell. Biology, 2005.

Transcription regulation by histone methylation: interplay between different covalent modifications of the core histone tails - Genes and Development, 2001

Acetylation of Histones and Transcription-Related Factors  - Microbiology and Molecular Biology Reviews, 2000.

Linker histone binding and displacement: versatile mechanism for transcriptional regulation - FASEB J., 2000.

متیلاسیون DNA

 در متیلاسیون DNA ، گروه متیل ( CH3 ) به باز های سیتوزین DNA اضافه می شود. این عمل با چند مکانیسم مختلف (شکل ) بر روی رونویسی ژن ها اثر می گذارد. ( شکل ) بنابراین متیلاسیون DNA نقش مهمی را تفاوت سلولی در طی رشد ایفا می کند.

برای بهتر دیدن عکس آن را ذخیره کنید

Review Articles:

DNA Methylation - Blood, 1999.

DNA Methylation and Cancer - J. Clin. Oncology, 2004

  

 

اپی ژنتیک

اپی ژنتیک مطالعه تغییرات موروثی کروماتین بدون تغییر در سکانس های DNA  است .

Review Articles:

The Epigenetic Face of Systemic Lupus Erythematosus - J. Immunology, 2006.

The emerging science of epigenomics - Hum. Mol. Genet., 2006.

Epigenetics (10+ articles) -  Hum. Mol. Genet., 2005.

DNA methylation patterns and epigenetic memory - Genes and Development, 2002.

Epigenetic gene silencing in cancer - J. Clinical Investigation, 2000.

Imprinting

• A view through the clouds of imprinting - FASEB J., 2001.
• Imprinting in the Germ Line - Stem Cells, 2001.
• The impact of genomic imprinting for neurobehavioral and developmental disorders - J. Clinical Investigation, 2000.
• Beckwith-Wiedemann syndrome: imprinting in clusters revisited - J. Clinical Investigation, 2000.

Chromatin Remodeling

Review Articles:

Lashings of DNA methylation, forkfuls of chromatin remodeling - Genes and Development, 2001.

ATP-dependent remodeling and acetylation as regulators of chromatin fluidity - Genes and Development, 1999.

ATP-Dependent Chromatin-Remodeling Complexes - Molecular and Cellular Biology, 2000.

Chromatin Remodeling and Leukemia: New Therapeutic Paradigms - Blood, 1999.